Отмечая прогрессивный характер идеи индивидуализации обучения, также выделяются и недостатки, которые не решены ни практикой, ни теорией западных школ. Во-первых, ослабляется непосредственная руководящая роль учителя; во-вторых, обучение ориентируется на воспроизводящее содержание материала; в-третьих, отсутствие единой общеобразовательной базы и критериев работы учащихся снижает уровень самого обучения; в-четвертых, большую сложность представляет организация обучения. Данные недостатки приводят к разному качеству образования не только в различных городах, школах, но и внутри самого класса. Если каждый ученик имеет право сделать выбор учебных предметов (помимо обязательных) и уровень трудности обучения, и это позволяет набрать определенное количество баллов и занять место в рейтинговой таблице, то от этого будет зависить, получит ли учащийся диплом или сертификат об окончании учебного заведения и во многом станет определяющим его дальнейшую образовательную судьбу.

Современной отечественной педагогикой, было многое сделано для того, чтобы показать сложный путь поиска более совершенной системы образования. Анализ западного опыта позволит ей избежать уже допущенных ошибок, и эффективней использовать продуктивные находки. К ним можно отнести гибкую структуру построения процесса обучения, учет индивидуальных умственных способностей и возможность заниматься на определенном уровне, трудности, а также построение коллективной работы с учетом индивидуальных способностей. Таким образом, отечественный опыт индивидуализации реализовывается на поиске новых путей организации обучения, направленных на реорганизацию системы образования. Так, например, в качестве основного из них был предложен бригадно-лабораторный метод - это такой путь обучения, когда учащиеся под руководством преподавателя самостоятельно ставят различные опыты и путем непосредственных восприятий усваивают определенные знания и навыки.